为共同应对国际竞争，汉堡港与易北河下游以及北海和波罗的海沿岸的港口开展密切合作，希望从运输地理学角度，最大程度地发挥其在北海和波罗的海之间的位置优势，进一步凸显北德地区在利益共享的同时保留自身特点的港区定位。当前的合作措施包括各港口间定期交流港口发展规划方面的数据与经验，就企业入驻和土地分配进行密切协商，并谋求联合营销，以突出相关港口的实际区位优势。
汉堡港目前通过易北河侧运河和中德运河与德国内河航道网相连。内陆港口是潜在的高性能内陆交通枢纽，这一趋势在考虑到集装箱运输的中期预期增长时尤为显著。它们大多兼容三大运输方式，涉及铁路、水路和高速公路网。它们主要负责处理大宗货物、一般货物、集装箱货物和重型货物的常规运输服务。内陆港口之间的密切合作为发展和维持多式联运港口内陆交通提供了巨大潜力。
与合作伙伴开展跨境交流是国际上一切知识与技术流通的基本要素。通过在基础设施建设、市场相关趋势、信息技术创新解决方案等方面的经验交流，合作港口能够相互学习，加强两国之间的经济联系。早在1992年，汉堡就与日本横滨港建立了第一个官方港口伙伴关系。