多年来，集装箱都是汉堡港的特色之一，集装箱装卸业务也是这个德国最大海港的主营业务。HHLA 集团旗下Altenwerder、Burchardkai和 Tollerort 的集装箱码头以及欧门码头都足以证明，集装箱运输业务对汉堡的重要性。

2025年，汉堡港装运了830万标准箱（TEU）。按货重计，集装箱吞吐量达到8,100万吨，占港口总吞吐量的近71%。集装箱货物在散杂货中的占比（即集装箱化率）达到98.6%。

载货集装箱对于价值链尤为重要。2025年这一数量达到700万标准箱，占全部集装箱吞吐量的84%以上。